RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	GPX6	P59796	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GTF2H2	Q13888	395 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GRTP1	Q5TC63	336 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	RAPH1	Q70E73	1250 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MEIOB	Q8N635	442 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FIG4	Q92562	907 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TMBIM1	Q969X1	311 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SLC35A4	Q96G79	324 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	COL21A1	Q96P44	957 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	IPPK	Q9H8X2	491 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SNX24	Q9Y343	169 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	C1orf226	A1L170	272 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FRG2C	A6NGY1	282 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KLF4	O43474	513 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TSPAN2	O60636	221 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	REM1	O75628	298 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CLDN9	O95484	217 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CD8B	P10966	210 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PEPD	P12955	493 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GFAP	P14136	432 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TBXA2R	P21731	343 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GRK2	P25098	689 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	DPP4	P27487	766 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GAS1	P54826	345 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SIRPA	P78324	504 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	DUSP2	Q05923	314 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TNK1	Q13470	666 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	AHSP	Q9NZD4	102 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	DKKL1	Q9UK85	242 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	THBD	P07204	575 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GSTA2	P09210	222 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	NID1	P14543	1247 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MAPK12	P53778	367 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ATP5J2	P56134	94 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	EFR3A	Q14156	821 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FGFBP1	Q14512	234 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	LTB4R	Q15722	352 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	BEX5	Q5H9J7	111 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	METTL4	Q8N3J2	472 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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