RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-215ENST00000563295 FCRL1Q96LA6 429 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 GNRHR2Q96P88 292 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 UBQLN3Q9H347 655 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.1□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 POLQO75417 2590 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 TMEM114B3SHH9 223 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 DYNC1I1O14576 645 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PIP5K1BO14986 540 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PDPK1O15530 556 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 AKAP10O43572 662 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 UGT2B11O75310 529 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 IFI6P09912 130 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 BCKDHAP12694 445 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 COX6B1P14854 86 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 GABRA1P14867 456 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 SDC1P18827 310 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 MAPK1P28482 360 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 IL12BP29460 328 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PTGER4P35408 488 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 MC3RP41968 323 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ETV4P43268 484 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ASMTP46597 345 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 TOMM20Q15388 145 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 CDSNQ15517 529 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 GALNTL6Q49A17 601 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 TMEM107Q6UX40 140 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 OR2L13Q8N349 312 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 AGR3Q8TD06 166 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PPCDCQ96CD2 204 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ELP4Q96EB1 424 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 SLC35A4Q96G79 324 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 TSSK3Q96PN8 268 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 NODALQ96S42 347 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 ADOQ96SZ5 270 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 TTYH2Q9BSA4 534 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 REEP4Q9H6H4 257 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 RNF6Q9Y252 685 aa9.09□□□□□ -0.95
KIFC3-215ENST00000563295 FBN2P35556 2912 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 TTC36A6NLP5 189 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 AHRRA9YTQ3 701 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 UPK1AO00322 258 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 GNB5O14775 395 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 SNPHO15079 494 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 TM9SF1O15321 606 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 BIRC5O15392 142 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 TSPAN2O60636 221 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 TBX19O60806 448 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 CBR3O75828 277 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 GLI4P10075 376 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 PTPN6P29350 595 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 GCKP35557 465 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 SERPINB4P48594 390 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 PNLIPRP2P54317 469 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 NUP107P57740 925 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 DESI1Q6ICB0 168 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 RTL6Q6ICC9 239 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.08□□□□□ -0.96
KIFC3-215ENST00000563295 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms