RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	ICOSLG	O75144	302 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SASH3	O75995	380 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRPS2	P11908	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	COL8A1	P27658	744 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	PTGS2	P35354	604 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	OCRL	Q01968	901 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	RBPJ	Q06330	500 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC34A3	Q8N130	599 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	COQ8B	Q96D53	544 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SH3GL2	Q99962	352 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	DOHH	Q9BU89	302 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	NTM	Q9P121	344 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	DNAJC13	O75165	2243 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACOT7	O00154	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SDHD	O14521	159 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF195	O14628	629 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	REM1	O75628	298 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLITRK5	O94991	958 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	IFI6	P09912	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ABO	P16442	354 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAPK1	P28482	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	GAS1	P54826	345 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	CLDN8	P56748	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	C21orf58	P58505	322 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	PHC1	P78364	1004 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	MLC1	Q15049	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	CDSN	Q15517	529 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SMU1	Q2TAY7	513 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRIL	Q7L0X0	811 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAVS	Q7Z434	540 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	RPRML	Q8N4K4	120 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC35A4	Q96G79	324 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	UBQLN3	Q9H347	655 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	THAP1	Q9NVV9	213 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	MEMO1	Q9Y316	297 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	FREM3	P0C091	2139 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PRB8	838 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	GNB5	O14775	395 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SCN2B	O60939	215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	COQ9	O75208	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	SNX4	O95219	450 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	IGKV1D-16	P01601	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	KIT	P10721	976 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	CYP4B1	P13584	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	PNLIPRP2	P54317	469 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRKAG1	P54619	331 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	WNT3	P56703	355 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	CPTP	Q5TA50	214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM198	Q66K66	360 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RASGRF1-208	ENST00000561112	CD163	Q86VB7	1156 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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