RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ACOX3O15254 700 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 LIASO43766 372 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 UGT2B11O75310 529 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SH3BGRLO75368 114 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 HAUS5O94927 633 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SLC35E2P0CK97 266 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 IL11P20809 199 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GRK2P25098 689 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 HNMTP50135 292 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SLMAPQ14BN4 828 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PPA1Q15181 289 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ARMC3Q5W041 872 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 C4orf22Q6V702 233 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SSX8Q7RTT4 187 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 TRIM58Q8NG06 486 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 NXNL1Q96CM4 212 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 NOTCH1P46531 2555 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 MED12Q93074 2177 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 MAGEB16A2A368 324 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 VWC2LB2RUY7 222 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ZIC3O60481 467 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 REM1O75628 298 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 LY6HO94772 140 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 CLPSP04118 112 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 NR2F6P10588 404 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PCNAP12004 261 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 NT5EP21589 574 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GPX3P22352 226 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PIK3R1P27986 724 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 IL12BP29460 328 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 CHN2P52757 468 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 CLDN20P56880 219 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 HILS1P60008 231 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 CDK16Q00536 496 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 LAPTM5Q13571 262 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SNX1Q13596 522 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SPA17Q15506 151 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 C18orf63Q68DL7 685 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 DESI1Q6ICB0 168 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 COL21A1Q96P44 957 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SERPINB12Q96P63 405 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 IFNKQ9P0W0 207 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.6□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GLOD5A6NK44 160 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SCELO95171 688 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 AIFM1O95831 613 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 TGFB1P01137 390 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 AGTR1P30556 359 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GDF5P43026 501 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 TERF1P54274 439 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 EFR3AQ14156 821 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 P2RY6Q15077 328 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.59□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF544Q6NX49 715 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms