RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		Q96MF0	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR54	Q9H977	334 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PCTP	Q9UKL6	214 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		F5H697	171 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MANBA	O00462	879 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	E2F3	O00716	465 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SOCS6	O14544	535 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	STX16	O14662	325 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KLK8	O60259	260 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL41	O60662	606 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	LDB3	O75112	727 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	UNC5C	O95185	931 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HP	P00738	406 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT6A	P02538	564 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT6B	P04259	564 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ALPP	P05187	535 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CELA2A	P08217	269 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KIT	P10721	976 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ICAM2	P13598	275 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CREB1	P16220	341 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EPOR	P19235	508 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IL10	P22301	178 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GATA3	P23771	443 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CASP2	P42575	452 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEA12	P43365	314 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT6C	P48668	564 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PRKAA2	P54646	552 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MLLT10	P55197	1068 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	LIM2	P55344	173 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB38	P57729	211 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ARG2	P78540	354 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ASPH	Q12797	758 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KLRB1	Q12918	225 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RCN2	Q14257	317 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TBCC	Q15814	346 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NADK2	Q4G0N4	442 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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