RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAP00813 363 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPN1LWP04000 364 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF23P17027 643 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPX3P22352 226 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRK2P25098 689 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF17Q02223 184 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPOCK1Q08629 439 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P2RY6Q15077 328 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A25Q6T423 547 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LUZP1Q86V48 1076 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKP2Q99959 881 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITPAQ9BY32 194 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DSN1Q9H410 356 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EHD1Q9H4M9 534 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.04□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2M5A3KFT3 312 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H7C417 338 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GMFGO60234 142 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REM1O75628 298 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN9O95484 217 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARAFP10398 606 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCNAP12004 261 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAGAP17050 411 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL11P20809 199 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NT5EP21589 574 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTM2P28161 218 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPM4P67936 248 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SVOPLQ8N434 492 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF175Q8N4F7 328 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMBIM1Q969X1 311 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMCO6Q96DC7 493 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A8Q9BY19 250 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51B5Q9H339 312 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NT5DC2Q9H857 520 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED11Q9P086 117 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.03□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESPNB1AK53 854 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFS8O00217 210 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCO2O43819 266 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF4O60810 478 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35E2P0CK97 266 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPIPA8P0DM63 369 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HILS1P60008 231 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX5Q13190 355 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLMAPQ14BN4 828 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPA1Q15181 289 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD7Q92527 254 aa9.02□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESAMQ96AP7 390 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms