RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309		H3BTX0	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	PDXK	O00764	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	ABCC4	O15439	1325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	CSRP3	P50461	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	ZP4	Q12836	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	ZIC1	Q15915	447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	MICA	Q29983	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP4-208	ENST00000530309	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RRAS	P10301	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	METAP1	P53582	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	IST1	P53990	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	DPYS	Q14117	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309		H0YL77	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ALOX15B	O15296	676 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TOM1L1	O75674	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RHBDL1	O75783	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TRIM16	O95361	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TSPAN8	P19075	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	IGFBP5	P24593	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	POU3F4	P49335	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CD86	P42081	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	HTR5A	P47898	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	MTTP	P55157	894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309		Q1RN00	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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