RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	POU3F4	P49335	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	SGSH	P51688	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RAG2	P55895	527 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	BPIFB3	P59826	476 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HAND2	P61296	217 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	EMC2	Q15006	297 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RDH11	Q8TC12	318 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	BIRC7	Q96CA5	298 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	SAMD8	Q96LT4	415 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	DCTPP1	Q9H773	170 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	PANK3	Q9H999	370 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HPS4	Q9NQG7	708 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	MEGF6	O75095	1541 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	NLRP1	Q9C000	1473 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A1B0GTH9	108 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A1W2PQ72	361 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	KRT87P	A6NCN2	255 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400		H3BMH7	237 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	E2F3	O00716	465 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHEK1	O14757	476 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPP2R1A	P30153	589 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HMGCL	P35914	325 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF85	Q03923	595 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	LTB4R	Q15722	352 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	C1orf189	Q5VU69	101 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	FBXL22	Q6P050	247 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	NEK5	Q6P3R8	708 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	FGFRL1	Q8N441	504 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RASL10A	Q92737	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCDC51	Q96ER9	411 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ARMCX1	Q9P291	453 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF253	O75346	499 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	MT-ATP6	P00846	226 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	IGHV3-9	P01782	118 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CAMLG	P49069	296 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF33B	Q06732	778 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	GAMT	Q14353	236 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CEBPE	Q15744	281 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CNST	Q6PJW8	725 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPATCH11	Q8N954	259 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	CPXM1	Q96SM3	734 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CTNNA1-222	ENST00000520400	ALG9	Q9H6U8	611 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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