RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FCGR3BO75015 233 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSF2P04141 144 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDI1P31150 447 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAA4P35542 130 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NSFP46459 744 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAG2P55895 527 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FKBP1BP68106 108 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STK4Q13043 487 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1C1Q15619 314 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HYIQ5T013 277 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR142Q7Z601 462 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C12orf56Q8IXR9 622 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIGCQ92535 297 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RMDN2Q96LZ7 410 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2M2Q96R28 347 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TXN2Q99757 166 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COQ7Q99807 217 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LZTS2Q9BRK4 669 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KATNB1Q9BVA0 655 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH2D2AQ9NP31 389 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ITM2BQ9Y287 266 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPV2Q9Y5S1 764 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBN2P35556 2912 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AFF2P51816 1311 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPY2A6NKD2 308 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YJEFN3A6XGL0 299 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B4GALT5O43286 388 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYT7O43581 403 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EFNA2O43921 213 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDE5AO76074 875 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCCBP05166 539 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD34CP0C6C1 535 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPY3P0CV98 308 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPY4P0CV99 314 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPY8P0CW00 308 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPY10P0CW01 314 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPY1RP25929 384 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMB4P28070 264 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIR2DS4P43632 304 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MZT1Q08AG7 82 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WTAPQ15007 396 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAMK4Q16566 473 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRY2Q49AN0 593 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEDAGQ5VYS4 303 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHST3Q7LGC8 479 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LUZP1Q86V48 1076 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCTD6Q8NC69 237 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GIMAP1Q8WWP7 306 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM158Q8WZ71 300 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5orf30Q96GV9 206 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SSX3Q99909 188 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDF3Q9NR23 364 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDAP2Q9NXN4 497 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TUBAL3A6NHL2 446 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAM20O43506 726 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLITRK3O94933 977 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGLSO95336 258 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HOXB7P09629 217 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GHRP10912 638 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALOX12P18054 663 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSPA4P34932 840 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTTPP55157 894 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAND2P61296 217 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC39A6Q13433 755 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAGHQ16775 308 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NCR3LG1Q68D85 454 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR9A1PQ8NGU1 263 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MCHR2Q969V1 340 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TIGD1Q96MW7 591 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPAS2Q99743 824 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GHITMQ9H3K2 345 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXD2Q9NVH0 621 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IFT52Q9Y366 437 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1B0GW55 424 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms