RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM169	Q96HH4	297 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF170	Q96K19	258 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ERCC3-208	ENST00000491292	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PITPNM1	O00562	1244 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ALDH1A1	P00352	501 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TF	P02787	698 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TCRB	P04435	133 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GCGR	P47871	477 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SIAH3	Q8IW03	269 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NRM	Q8IXM6	262 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXL6	Q8N531	539 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR51A7	Q8NH64	312 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR6C74	A6NCV1	312 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM25E	A8MYX2	175 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC19A2	O60779	497 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SPINT3	P49223	89 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	B4GALNT1	Q00973	533 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ELP2	Q6IA86	826 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM163	Q8TC26	289 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SAMD8	Q96LT4	415 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PHF11	Q9UIL8	331 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	COPS3	Q9UNS2	423 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	IRGM	A1A4Y4	181 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC5	O15389	551 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDEF	O95238	335 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	F11	P03951	625 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GABRA5	P31644	462 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CENPA	P49450	140 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	AANAT	Q16613	207 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RPTN	Q6XPR3	784 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CHST9	Q7L1S5	443 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ST8SIA4	Q92187	359 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SMPDL3A	Q92484	453 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RRAGC	Q9HB90	399 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MLX	Q9UH92	298 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2QL1	A1L167	161 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FFAR1	O14842	300 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SIX6	O95475	246 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FURIN	P09958	794 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GABRB1	P18505	474 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	IMPA1	P29218	277 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CDK20	Q8IZL9	346 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF480	Q8WV37	535 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FATE1	Q969F0	183 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PPA2	Q9H2U2	334 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CHP2	O43745	196 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	EFCAB14	O75071	495 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHL18	O94889	574 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	UCHL1	P09936	223 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ACP2	P11117	423 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	IL32	P24001	234 aa		9.26	□□□□□ -0.93

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