RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM64Q6YI46 380 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP90Q8TF47 636 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RELTQ969Z4 430 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ELP4Q96EB1 424 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 UCK1Q9HA47 277 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 THSD1Q9NS62 852 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RGS5O15539 181 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TNFSF14O43557 240 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SDHBP21912 280 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CA5AP35218 305 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MED22Q15528 200 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL22Q53GT1 634 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RAET1LQ5VY80 246 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ENPP6Q6UWR7 440 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 FANCFQ9NPI8 374 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PATJQ8NI35 1801 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 GK3PQ14409 553 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 EXT1Q16394 746 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PRR22Q8IZ63 422 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ANKFN1Q8N957 763 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SNX33Q8WV41 574 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 COQ8BQ96D53 544 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PIGUQ9H490 435 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 FAM227AF5H4B4 570 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF195O14628 629 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MAOAP21397 527 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ARRB2P32121 409 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MS4A2Q01362 244 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 DSG2Q14126 1118 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IL11RAQ14626 422 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IP6K3Q96PC2 410 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL1Q9NR64 748 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GTL3 188 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PRG6 482 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IDSB3KWA1 339 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CSO75390 466 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SYNGR4O95473 234 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 UBL4AP11441 157 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PRKACGP22612 351 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ARG2P78540 354 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 LTB4RQ15722 352 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CA13Q8N1Q1 262 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ETHE1O95571 254 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF28P17035 718 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PMS2P3Q13401 168 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IL18R1Q13478 541 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SYPL1Q16563 259 aa7.75□□□□□ -1.17
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