RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 WLSQ5T9L3 541 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ATG16L1Q676U5 607 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CLEC6AQ6EIG7 209 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EID3Q8N140 333 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SARAFQ96BY9 339 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ZNF597Q96LX8 424 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 UBQLN3Q9H347 655 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 CAPN14A8MX76 684 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ICOSLGO75144 302 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 HSPA4LO95757 839 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 CT45A8P0DMV1 189 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 CT45A9P0DMV2 189 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 DRD2P14416 443 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 DRD5P21918 477 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PRPH2P23942 346 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PPICP45877 212 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 STX3Q13277 289 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TOMM20Q15388 145 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 CHI3L2Q15782 390 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 DCST1Q5T197 706 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 KANK2Q63ZY3 851 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ACAD11Q709F0 780 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PACS2Q86VP3 889 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 OR7G2Q8NG99 324 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 OR4N2Q8NGD1 307 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ASB5Q8WWX0 329 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TMBIM1Q969X1 311 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ARL8AQ96BM9 186 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 EGLN2Q96KS0 407 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 LURAP1Q96LR2 239 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TIMP4Q99727 224 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 RUBCNLQ9H714 662 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TRAF6Q9Y4K3 522 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 B4DXG7 233 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 REM1O75628 298 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 SNX4O95219 450 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 IGFBP2P18065 325 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TACR1P25103 407 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PTPN6P29350 595 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 MASP1P48740 699 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 MPP2Q14168 576 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TIGD3Q6B0B8 471 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 LIX1Q8N485 282 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 NAXEQ8NCW5 288 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 OR2T11Q8NH01 316 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 ZNF675Q8TD23 568 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 SERHLQ9NQF3 203 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 HAO1Q9UJM8 370 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-211ENST00000478087 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms