RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 ALPPP05187 535 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TAS2R41P59536 307 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 INAVAQ3KP66 663 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 C12orf73Q69YU5 71 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 KIF18BQ86Y91 864 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PRRC1Q96M27 445 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SERINC2Q96SA4 455 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CENPOQ9BU64 300 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PINK1Q9BXM7 581 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FAM60AQ9NP50 221 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 POLE4Q9NR33 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 GIN1Q9NXP7 522 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CNIH4Q9P003 139 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FGF17O60258 216 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 APOL3O95236 402 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NPIPA8P0DM63 369 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SPTBP11277 2137 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 BMP4P12644 408 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 RGS6P49758 472 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ARFIP1P53367 373 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 YPEL5P62699 121 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SHC2P98077 582 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FZD2Q14332 565 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 GINS1Q14691 196 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DUSP5Q16690 384 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DGUOKQ16854 277 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PERM1Q5SV97 790 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CASP12Q6UXS9 341 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 Q6ZNX1 250 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FCGR1BQ92637 280 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 RSC1A1Q92681 617 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MOAP1Q96BY2 351 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CAPN10Q9HC96 672 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 IFT52Q9Y366 437 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CLDN25C9JDP6 229 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SGK494L7N484 410 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 THY1P04216 161 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 THEGLP0DJG4 465 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ACP2P11117 423 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CPMP14384 443 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ALOX12P18054 663 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC15A1P46059 708 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SMIM11AP58511 58 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 GPR68Q15743 365 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PIK3R3Q92569 461 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SH3D21A4FU49 640 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 C2orf74A8MZ97 194 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MPZL2O60487 215 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CYP7B1O75881 506 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CT62P0C5K7 136 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SOX3P41225 446 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 RABIFP47224 123 aa8.3□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 GIPRP48546 466 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms