RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473722.5

SCIN-205, Transcript of scinderin, human

TSL 4

Gene SCIN, Length 656 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCIN-205	ENST00000473722	SLC18A1	P54219	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RALGDS	Q12967	914 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SGCG	Q13326	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IHH	Q14623	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TMED2	Q15363	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CDKN3	Q16667	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KLC3	Q6P597	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	COPS8	Q99627	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GPR22	Q99680	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MMP28	Q9H239	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ASB8	Q9H765	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722		A0A0B4J293	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722		A0A1W2PP11	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722		E5RI56	91 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TM9SF1	O15321	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	VEGFD	O43915	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FGF17	O60258	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GLRA3	O75311	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	VPS26A	O75436	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZWINT	O95229	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SEMA4F	O95754	770 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	C1QA	P02745	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FTH1	P02794	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MT-ND3	P03897	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	APOA4	P06727	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GSTA1	P08263	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	STMN1	P16949	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	VCL	P18206	1134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GABRG2	P18507	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AOC1	P19801	751 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MSH3	P20585	1137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MT3	P25713	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AKT2	P31751	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DRD3	P35462	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GPR1	P46091	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CXCL12	P48061	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TPMT	P51580	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RAB10	P61026	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	XIAP	P98170	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PEX6	Q13608	980 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722		Q6ZS52	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms