RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 C1orf94Q6P1W5 598 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CA13Q8N1Q1 262 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SIMC1Q8NDZ2 872 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 Q96MT0 163 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 IL21RQ9HBE5 538 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 MKLN1Q9UL63 735 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 IFT52Q9Y366 437 aa16.06■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 M0R3G1 203 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 FRS3O43559 492 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 GPR75O95800 540 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ACP2P11117 423 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ST6GAL1P15907 406 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TNNI3P19429 210 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 IFNA8P32881 189 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 OCA2Q04671 838 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 DUSP5Q16690 384 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM52Q8NDY8 209 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 NDNFQ8TB73 568 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF675Q8TD23 568 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 STARD5Q9NSY2 213 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 WDR45Q9Y484 360 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CYP7B1O75881 506 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TP53P04637 393 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 NT5EP21589 574 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CDH3P22223 829 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ALDH4A1P30038 563 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 AVPR1BP47901 424 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 VBP1P61758 197 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 GAS6Q14393 721 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 IRF3Q14653 427 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TRAM2Q15035 370 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 FHL5Q5TD97 284 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 BORCS5Q969J3 196 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CRELD1Q96HD1 420 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PRR14Q9BWN1 585 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 FAM60AQ9NP50 221 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 A0A087WV62 115 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 M0R082 166 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ENTPD6O75354 484 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ADORA3P0DMS8 318 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 GSTM3P21266 225 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SOX18P35713 384 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 IFNGR2P38484 337 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 LIPAP38571 399 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ST3GAL3Q11203 375 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SYT16Q17RD7 645 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PIGUQ9H490 435 aa16.04■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SGK494L7N484 410 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 AP3D1O14617 1153 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 HCRTR1O43613 425 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PLOD3O60568 738 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ALOX5P09917 674 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 MLLT10P55197 1068 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ELOCQ15369 112 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 KLHL35Q6PF15 583 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 DIO2Q92813 273 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CDCA4Q9BXL8 241 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD19PQ9H560 264 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 A0A087WUU8 490 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 UBXN7O94888 489 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PTHP01270 115 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CD27P26842 260 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SLC15A1P46059 708 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 BMXP51813 675 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 RAB38P57729 211 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms