RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 SSTR4P31391 388 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 HMGCS1Q01581 520 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ADIPOR1Q96A54 375 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 MOKQ9UQ07 419 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 PLXNB1O43157 2135 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 SYNGR4O95473 234 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 NTN1O95631 604 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 HK1P19367 917 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 COMTP21964 271 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 NPY2RP49146 381 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 MAP4K2Q12851 820 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TRIP10Q15642 601 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF470Q6ECI4 717 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 LEG1Q6P5S2 330 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 OR51F2Q8NH61 342 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 DHRS7Q9Y394 339 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 DAOP14920 347 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 PGCP20142 388 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 CD40P25942 277 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GSTM2P28161 218 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 MLC1Q15049 377 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 PCID2Q5JVF3 399 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM58Q8NG06 486 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 NANPQ8TBE9 248 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TANKQ92844 425 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TMCO6Q96DC7 493 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 OMA1Q96E52 524 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 KCNC2Q96PR1 638 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TREX1Q9NSU2 369 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 STOML1Q9UBI4 398 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 G3V4G9 280 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 UGT2B11O75310 529 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 CLEC3AO75596 197 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 LYZL6O75951 148 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 VAPBO95292 243 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM253P0C7T8 217 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 IFNGR1P15260 489 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GRK2P25098 689 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GRIA1P42261 906 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF83P51522 516 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 NNATQ16517 81 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 P2RY8Q86VZ1 359 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 KCNJ9Q92806 393 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A28Q96A46 364 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 VPS39Q96JC1 886 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 GPR21Q99679 349 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 CITED1Q99966 193 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 FKRPQ9H9S5 495 aa11.72□□□□□ -0.53
C9orf3-211ENST00000463372 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms