RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GPR141Q7Z602 305 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OOSP2Q86WS3 158 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ARL14Q8N4G2 192 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CSNK1A1LQ8N752 337 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 OR10G6Q8NH81 332 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 PRRC1Q96M27 445 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GUCD1Q96NT3 240 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 APOL4Q9BPW4 351 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 GNA13Q14344 377 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GANABQ14697 944 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
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