RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456075.5

TOP3B-212, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 4

Gene TOP3B, Length 561 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-212ENST00000456075 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 JADE3Q92613 823 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 VSTM2LQ96N03 204 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 RILPQ96NA2 401 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 COL21A1Q96P44 957 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ADOQ96SZ5 270 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ASIC5Q9NY37 505 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 A0A1B0GTH9 108 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 TTC36A6NLP5 189 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CCL21O00585 134 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 KLF11O14901 512 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 EMC8O43402 210 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 UGT2B11O75310 529 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 KCNH1O95259 989 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 TPOP07202 933 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 IFI6P09912 130 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CT45A8P0DMV1 189 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CT45A9P0DMV2 189 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 LAMP1P11279 417 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GDF1P27539 372 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SOAT1P35610 550 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SOX18P35713 384 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CASP3P42574 277 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 DIO3P55073 304 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CLDN8P56748 225 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 PPP2R2AP63151 447 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 HSF1Q00613 529 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SNTA1Q13424 505 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SLC10A1Q14973 349 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 MLC1Q15049 377 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 BICRALQ6AI39 1079 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 NUP43Q8NFH3 380 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GPR151Q8TDV0 419 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SLC9A6Q92581 669 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ZBTB18Q99592 522 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SH3GL2Q99962 352 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 DUSP26Q9BV47 211 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CBLCQ9ULV8 474 aa9.5□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 SDHDO14521 159 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 DIAPH2O60879 1101 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 TRAPPC6AO75865 159 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 C6orf47O95873 294 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 KRT16P08779 473 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ALOX5P09917 674 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 EPHA3P29320 983 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GABRA3P34903 492 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 GCKP35557 465 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 CA7P43166 264 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 KIR3DL1P43629 444 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 MAN2A2P49641 1150 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 PRIM2P49643 509 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 PNLIPRP2P54317 469 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 OCRLQ01968 901 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 FOXO1Q12778 655 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 TP53BP2Q13625 1128 aa9.49□□□□□ -0.89
TOP3B-212ENST00000456075 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms