RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CHEK2O96017 543 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 IL3P08700 152 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NT5EP21589 574 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HK2P52789 917 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DLX5P56178 289 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 KCNJ2P63252 427 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ADAM8P78325 824 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 LTBQ06643 244 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 BIKQ13323 160 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MPEG1Q2M385 716 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZNF750Q32MQ0 723 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SPIN4Q56A73 249 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A10Q63ZE4 541 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RTL6Q6ICC9 239 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CGB2Q6NT52 195 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 FAM180BQ6P0A1 224 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 OR4K14Q8NGD5 310 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 KLHL29Q96CT2 875 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 C18orf12Q96KH6 178 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ART5Q96L15 291 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NPHS2Q9NP85 383 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 C1orf226A1L170 272 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 AHRRA9YTQ3 701 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 AZIN1O14977 448 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF9O43307 516 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 IL2RAP01589 272 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 UROSP10746 265 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 BMP5P22003 454 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.696e-12■■■■■ 39.4
PRAME-210ENST00000442481 FEN1P39748 380 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ADH7P40394 386 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 XKP51811 444 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RNF4P78317 190 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SLC48A1Q6P1K1 146 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SLC29A4Q7RTT9 530 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 LACC1Q8IV20 430 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 GALNT12Q8IXK2 581 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DDIASQ8IXT1 998 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PM20D2Q8IYS1 436 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SLC15A4Q8N697 577 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 NUBPLQ8TB37 319 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZNF721Q8TF20 911 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 CNIH4Q9P003 139 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 MCM8Q9UJA3 840 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 HAO1Q9UJM8 370 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 LIPGQ9Y5X9 500 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-210ENST00000442481 A0A0G2JMM0 328 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPB8 328 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PRS3 328 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 KIR3DP1A8MWS1 328 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 G3V3Y1 287 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SLC35E2P0CK97 266 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EPXP11678 715 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CPMP14384 443 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SSTR4P31391 388 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TIMP3P35625 211 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DNASE1L1P49184 302 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 RAE1P78406 368 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SORDQ00796 357 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 FOXO1Q12778 655 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TBCELQ5QJ74 424 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SHEQ5VZ18 495 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SPATA21Q7Z572 469 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 KIRREL3Q8IZU9 778 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 BCAS4Q8TDM0 211 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 C16orf78Q8WTQ4 265 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms