RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 DOHHQ9BU89 302 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MED18Q9BUE0 208 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 RHCGQ9UBD6 479 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NEU3Q9UQ49 428 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6C74A6NCV1 312 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCF5A8MTL0 148 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ALPIP09923 528 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ETV5P41161 510 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CCR6P51684 374 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 INSL4Q14641 139 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PLK5Q496M5 336 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 POC1BQ8TC44 478 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 COPS8Q99627 209 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MED9Q9NWA0 146 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 AKT3Q9Y243 479 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SHISA3A0PJX4 238 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NLC8 198 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM170BA6NMN3 283 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QZ92 97 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DPM1O60762 260 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GASTP01350 101 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SELLP14151 372 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GPX2P18283 190 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NOS3P29474 1203 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 POU3F4P49335 361 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SERTAD2Q14140 314 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HFEQ30201 348 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 AFMIDQ63HM1 303 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 VASNQ6EMK4 673 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf88Q6PI97 169 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NINJ1Q92982 152 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 BIN3Q9NQY0 253 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NPC1O15118 1278 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HPXP02790 462 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 RLN2P04090 185 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF806P0C7X5 589 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF286BP0CG31 522 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DRD5P21918 477 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GKP32189 559 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR3DL1P43629 444 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF6P49848 677 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL2L1Q07817 233 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 IL10RBQ08334 325 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 BRICD5Q6PL45 260 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CD200R1Q8TD46 325 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ9Q92806 393 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 BADQ92934 168 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OTULINQ96BN8 352 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms