RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 MATN1P21941 496 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCMT1P22061 227 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSMB5P28074 263 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 MPIP34949 423 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGFALSP35858 605 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 HMGA2P52926 109 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 SKP1P63208 163 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR20EP86478 221 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR20CP86479 221 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR20DP86480 221 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR20BP86481 221 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR20AP86496 221 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 E2F1Q01094 437 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIR2DS3Q14952 304 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAPTM4AQ15012 233 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 XKR5Q6UX68 686 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABHD13Q7L211 337 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRROSQ86YC3 692 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR2L3Q8NG85 312 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 FNDC8Q8TC99 324 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAR1Q8WVX9 515 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCN9Q8WX39 176 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR92Q96MX6 357 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL21A1Q96P44 957 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYOCQ99972 504 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 DPH7Q9BTV6 452 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 MENTQ9BUN1 341 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 LGR4Q9BXB1 951 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 RASSF1Q9NS23 344 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 MS4A12Q9NXJ0 267 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCND3Q9UK17 655 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0G2JPF8 293 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PPC4 97 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PR77 199 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 FEZF1A0PJY2 475 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 POM121CA8CG34 1229 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYT5O00445 386 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFRSF10CO14798 259 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 YKT6O15498 198 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 EFSO43281 561 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 EMC8O43402 210 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 MT-ND2P03891 347 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDK1P06493 297 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEACAM5P06731 702 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 HTR1AP08908 422 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms