RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 NRGNQ92686 78 aa19.1■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 TMBIM1Q969X1 311 aa19.1■□□□□ 0.65
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LIMS1-208ENST00000428064 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 GIMAP4Q9NUV9 329 aa19.1■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 MAPRE3Q9UPY8 281 aa19.1■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 WIF1Q9Y5W5 379 aa19.1■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 PLOD3O60568 738 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN2O60636 221 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 SLITRK5O94991 958 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 GOSR1O95249 250 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4B1P13584 511 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 HTR6P50406 440 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 GFRA1P56159 465 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 EFR3AQ14156 821 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 SCIMPQ6UWF3 145 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 PLCZ1Q86YW0 608 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 OR9A2Q8NGT5 310 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf78Q8WTQ4 265 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 APIPQ96GX9 242 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 SERHLQ9NQF3 203 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 PFDN4Q9NQP4 134 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 CBLCQ9ULV8 474 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 EDARQ9UNE0 448 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK7Q96N67 2140 aa19.09■□□□□ 0.65
LIMS1-208ENST00000428064 H3BQF6 201 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ERN1O75460 977 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SRD5A2P31213 254 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PNLIPRP2P54317 469 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 NAA20P61599 178 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 IFNEQ86WN2 208 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 IFT20Q8IY31 132 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 OR14L1PQ8NHC6 308 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MZB1Q8WU39 189 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC126Q96EE4 140 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TM9SF2Q99805 663 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SFXN3Q9BWM7 321 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GSTO2Q9H4Y5 243 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 C2CD3Q4AC94 2353 aa19.08■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf72A6NCS6 295 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 REM1O75628 298 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TACR1P25103 407 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MPIP34949 423 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF763Q0D2J5 394 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 AAGABQ6PD74 315 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 NPSR1Q6W5P4 371 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FAM9CQ8IZT9 166 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CEP112Q8N8E3 955 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf106Q8NAJ2 232 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ADOQ96SZ5 270 aa19.07■□□□□ 0.64
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LIMS1-208ENST00000428064 FOLH1BQ9HBA9 442 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R10Q9NYW0 307 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R9Q9NYW1 312 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 DCDC2Q9UHG0 476 aa19.07■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WV62 115 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TUBAL3A6NHL2 446 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 RCBTB2O95199 551 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EPXP11678 715 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 DDCP20711 480 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP24386 653 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 IL12BP29460 328 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 KRT20P35900 424 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO1A2P46721 670 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CORO7P57737 925 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CDC20BQ86Y33 519 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 KAT2AQ92830 837 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 WNT2BQ93097 391 aa19.06■□□□□ 0.64
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LIMS1-208ENST00000428064 EPB41L4BQ9H329 900 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CLCF1Q9UBD9 225 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GRID1Q9ULK0 1009 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM22Q9Y584 194 aa19.06■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 VPS13CQ709C8 3753 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 NF1P21359 2839 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MYO1GB0I1T2 1018 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 H0Y3Z8 333 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 COQ9O75208 318 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PYGBP11216 843 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 LHX2P50458 406 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 DGKQP52824 942 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GAS1P54826 345 aa19.05■□□□□ 0.64
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