RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 FBXL8Q96CD0 374 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SORT1Q99523 831 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SARGQ9BW04 601 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ALG9Q9H6U8 611 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 GAREM1Q9H706 876 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 UCK1Q9HA47 277 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 STARD5Q9NSY2 213 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OGFRQ9NZT2 677 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KCNK6Q9Y257 313 aa5.15□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KRT87PA6NCN2 255 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR5K4A6NMS3 321 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SYCE1LA8MT33 242 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 UBXN8O00124 270 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 E2F3O00716 465 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF195O14628 629 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 YKT6O15498 198 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 AQP9O43315 295 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 DFNA5O60443 496 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PPP1R3DO95685 299 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SLC16A8O95907 504 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 FGF4P08620 206 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 VCLP18206 1134 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TAC1P20366 129 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ACTR1BP42025 376 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CASP2P42575 452 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HNMTP50135 292 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ERVFC1-1P60608 527 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ACTR1AP61163 376 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HERVK_113P63132 956 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RHAGQ02094 409 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ELOCQ15369 112 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HLA-BQ31612 363 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 UGT3A2Q3SY77 523 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 UNC50Q53HI1 259 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 DPP10Q8N608 796 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 FAM76AQ8TAV0 307 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC126Q96EE4 140 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 WDR34Q96EX3 536 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC138Q96M89 665 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 C7orf26Q96N11 449 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM237Q96Q45 408 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR4K3Q96R72 315 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PKP4Q99569 1192 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 NRTNQ99748 197 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 MECRQ9BV79 373 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ERVK-6Q9BXR3 956 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 DRC3Q9H069 523 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 WWP1Q9H0M0 922 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CENPHQ9H3R5 247 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SPASTQ9UBP0 616 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PCTPQ9UKL6 214 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TMCO1Q9UM00 188 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PDZD2O15018 2839 aa5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.13□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.13□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 LILRA5A6NI73 299 aa5.13□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 K7ENP7 123 aa5.13□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 GAS8-AS1O95177 125 aa5.13□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms