RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SOX18P35713 384 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK9P45984 424 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR176Q14439 515 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MZT2AQ6P582 158 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SHFQ7M4L6 423 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TIGD4Q8IY51 512 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8H3Q8N146 312 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF680Q8NEM1 530 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXW2Q9UKT8 454 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ING4Q9UNL4 249 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR52Q9Y2T5 361 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SHISA3A0PJX4 238 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 K7ESM1 405 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RFXAPO00287 272 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC28A2O43868 658 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EPHX1P07099 455 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR12D1P0DN82 309 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CTNNB1P35222 781 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM11AP58511 58 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK5Q00535 292 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM15Q13444 863 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SNAPC1Q16533 368 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM240Q5SV17 173 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 BICRALQ6AI39 1079 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LIPIQ6XZB0 460 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCHQ86VS3 1027 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4K5Q8NGD3 323 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 UCN3Q969E3 161 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF21AQ96BD5 680 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00597Q9H2U6 94 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGUQ9H490 435 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MGAT4AQ9UM21 535 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ASB4Q9Y574 426 aa17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 IRGMA1A4Y4 181 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP20O60882 483 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR7A10O76100 309 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LIMS3P0CW19 117 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LIMS4P0CW20 117 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 COX10Q12887 443 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM107Q6UX40 140 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CD300LDQ6UXZ3 194 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCH9Q86YJ5 346 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5P2Q8WZ92 322 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 F2RL3Q96RI0 385 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF32Q9H0A6 362 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MED28Q9H204 178 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5DC2Q9H857 520 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TAS2R7Q9NYW3 318 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM30Q9UKF2 790 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR23AA6NEV1 266 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PRODHO43272 600 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LALBAP00709 142 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC6A1P30531 599 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP12P39900 470 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS1Q08116 209 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 DSG2Q14126 1118 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 DPPA4Q7L190 304 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 VN1R2Q8NFZ6 395 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF607Q96SK3 696 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TMED9Q9BVK6 235 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFP64Q9NPA5 681 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa17.24■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CARNS1A5YM72 827 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC19A2O60779 497 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TYRP14679 529 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EN2P19622 333 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ENPP1P22413 925 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP12AP54707 1039 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE3AQ05086 875 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 IKZF1Q13422 519 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA1AQ53H76 456 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC17Q8N6Y2 441 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF485Q8NCK3 441 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 POF1BQ8WVV4 589 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC9A6Q92581 669 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 FNDC11Q9BVV2 318 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EGLN3Q9H6Z9 239 aa17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms