RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q96MF0 132 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL21A1Q96P44 957 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCTPQ9UKL6 214 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBN3Q75N90 2809 aa11.93□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX16O14662 325 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRHP06850 196 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCSK2P16519 638 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYK2P29597 1187 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCYT1AP49585 367 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM27E3Q08E93 113 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2A2Q6IF42 318 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM180BQ6P0A1 224 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL19Q99731 98 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS11Q9H270 941 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSME2Q9UL46 239 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARID1AO14497 2285 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JMJD1CQ15652 2540 aa11.92□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REM1O75628 298 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FPR1P21462 350 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYGSP22914 178 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCKARP32238 428 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD79BP40259 229 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MC3RP41968 323 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH9A1P49189 494 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUCY2DQ02846 1103 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACKR1Q16570 336 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGO1Q5FBB7 561 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VWA1Q6PCB0 445 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF675Q8TD23 568 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STARD4Q96DR4 205 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF681Q96N22 645 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD9Q96Q07 612 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADOQ96SZ5 270 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAIM2Q9BWQ8 316 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB17Q9H0T7 212 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XPR1Q9UBH6 696 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCO1Q9UM00 188 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A20A6NK97 555 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4DXG7 233 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN2O60636 221 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDYNP01213 254 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRK2P25098 689 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPP4P27487 766 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCSK6P29122 969 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL12BP29460 328 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFR3AQ14156 821 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRADDQ15628 312 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL2A1Q16548 175 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF138Q8WVD3 245 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENOMQ8WWX9 145 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PERPQ96FX8 193 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED18Q9BUE0 208 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BDH2Q9BUT1 245 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRF2Q9HAW0 419 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTS2RQ9UKP6 389 aa11.9□□□□□ -0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms