RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 CNBD2Q96M20 576 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 COL21A1Q96P44 957 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DGAT2Q96PD7 388 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 EPYCQ99645 322 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PIP5K1AQ99755 562 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 ADI1Q9BV57 179 aa6.2□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.2□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.2□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.2□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PATE3B3GLJ2 98 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DSCR3O14972 297 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 DYRK3O43781 588 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 HS6ST1O60243 411 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJB5O75953 348 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DIRAS1O95057 198 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TNFAIP8O95379 198 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MED26O95402 600 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 H6PDO95479 791 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 AK1P00568 194 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 ALPLP05186 524 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ALPPP05187 535 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LYNP07948 512 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CHRM4P08173 479 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CKMT1AP12532 417 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RHCEP18577 417 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TNNI3P19429 210 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TNFRSF1BP20333 461 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CD247P20963 164 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 MPLP40238 635 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 STT3AP46977 705 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR1E2P47887 323 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 IST1P53990 364 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SPIBQ01892 262 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 BLMHQ13867 455 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MAPK11Q15759 364 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LPAL2Q16609 132 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC36A3Q495N2 470 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 PERM1Q5SV97 790 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FHL5Q5TD97 284 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CARM1Q86X55 608 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 IFI44Q8TCB0 444 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PMM1Q92871 262 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CDS1Q92903 461 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GATA6Q92908 595 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC8-211ENST00000415409 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35A4Q96G79 324 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 POM121Q96HA1 1249 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR1F2PQ96R84 312 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 STACQ99469 402 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PINK1Q9BXM7 581 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.19□□□□□ -1.42
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