RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409617.5

SERF2-208, Transcript of small EDRK-rich factor 2, human

TSL 2

Gene SERF2, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF2-208	ENST00000409617	OR52E6	Q96RD3	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617		Q9N2J8	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	DEPP	Q9NTK1	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF2-208	ENST00000409617	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	TSPAN2	O60636	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	ABCB7	O75027	752 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SOX30	O94993	753 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617		P04436	131 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	CCL3	P10147	92 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	UQCRC2	P22695	453 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	ARFIP2	P53365	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SQLE	Q14534	574 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FAR1	Q8WVX9	515 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	HGD	Q93099	445 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	TMBIM1	Q969X1	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SLC35A4	Q96G79	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	UGT2B11	O75310	529 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	REM1	O75628	298 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	ACP2	P11117	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	GABRA3	P34903	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	PIGA	P37287	484 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	MEOX1	P50221	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	RCAN2	Q14206	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	CDC73	Q6P1J9	531 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SZRD1	Q7Z422	152 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	OR2M7	Q8NG81	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	DIO2	Q92813	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	STAC	Q99469	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SERHL	Q9NQF3	203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	IL33	O95760	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	KRT16	P08779	473 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	ALOX5	P09917	674 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	SOAT1	P35610	550 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	KRT20	P35900	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	MAN2A2	P49641	1150 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	GPR85	P60893	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FOXK1	P85037	733 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	PMP22	Q01453	160 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FOXO1	Q12778	655 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	EFR3A	Q14156	821 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	DUSP5	Q16690	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	DECR1	Q16698	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF2-208	ENST00000409617	FAM110B	Q8TC76	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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