RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 GALNT11Q8NCW6 608 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 NR4A3Q92570 626 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 DIO2Q92813 273 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 DCTN4Q9UJW0 460 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PGRP06401 933 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF24P17028 368 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 IL12BP29460 328 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 NPSR1Q6W5P4 371 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 OR2M7Q8NG81 312 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 OR4A15Q8NGL6 344 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SFXN5Q8TD22 340 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 RILPQ96NA2 401 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 OR52E6Q96RD3 313 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 CXorf36Q9H7Y0 433 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD33BA6NCL7 494 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 OR6C70A6NIJ9 312 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 DECR1Q16698 335 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 CLECL1Q8IZS7 167 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SPPL2AQ8TCT8 520 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 TMCO6Q96DC7 493 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 COL21A1Q96P44 957 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 DEPPQ9NTK1 212 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 CBLCQ9ULV8 474 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM33Q9UPN9 1127 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 A0A0G2JND7 137 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 G3V3Y1 287 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SCN2BO60939 215 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SOX30O94993 753 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 KRT16P08779 473 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 EDN3P14138 238 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 IL12AP29459 219 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 GABRA3P34903 492 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SOAT1P35610 550 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 KCNJ2P63252 427 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PHC1P78364 1004 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 GAB1Q13480 694 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 TP53BP2Q13625 1128 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 EFR3AQ14156 821 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PRAMEF20Q5VT98 475 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 MFSD12Q6NUT3 480 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD46Q86W74 232 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 GPR151Q8TDV0 419 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SLC9A6Q92581 669 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SLX1AQ9BQ83 275 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 BTNL2Q9UIR0 455 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ACOT7O00154 380 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 KCNH1O95259 989 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PIGAP37287 484 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 DGKQP52824 942 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PLGLB1Q02325 96 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 JADE3Q92613 823 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 GIMAP5Q96F15 307 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SLC35A4Q96G79 324 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ADOQ96SZ5 270 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 C9JVG2 144 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 SNX4O95219 450 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ALOX5P09917 674 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PNLIPRP2P54317 469 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 TRIML2Q8N7C3 387 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 OR4N2Q8NGD1 307 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 RFWD2Q8NHY2 731 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 CHMP6Q96FZ7 201 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC115Q96NT0 180 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 DOHHQ9BU89 302 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 ACTRT3Q9BYD9 372 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 RABEP2Q9H5N1 569 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 METTL7AQ9H8H3 244 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-204ENST00000400919 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 FAM234BA2RU67 622 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TFECO14948 347 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 HS6ST1O60243 411 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 UGT2B11O75310 529 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 NKX2-2O95096 273 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 DNASE1L1P49184 302 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 KRTCAP3Q53RY4 240 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PAOXQ6QHF9 649 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PACS2Q86VP3 889 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SLC22A16Q86VW1 577 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 OR5AK3PQ8NH89 298 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PANX1Q96RD7 426 aa25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms