RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396352.8

HOXA3-202, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA3, Length 3,263 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-202ENST00000396352 SERPIND1P05546 499 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CEBPBP17676 345 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 HLA-DMAP28067 261 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ENKURQ8TC29 256 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 C5orf42Q9H799 3197 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 A0A1W2PS29 197 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 PGRMC2O15173 223 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 HCN1O60741 890 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 FAM157BP0CG42 384 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 NTSP30990 170 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 OMPP47874 163 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 QPRTQ15274 297 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SFXN5Q8TD22 340 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 DIO2Q92813 273 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 KLK6Q92876 244 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 IRAK3Q9Y616 596 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CASKO14936 926 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 NCR1O76036 304 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CPN2P22792 545 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TAS2R41P59536 307 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 VASNQ6EMK4 673 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 Q8N402 240 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ZG16BQ96DA0 208 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 BBS4Q96RK4 519 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ARHGDIGQ99819 225 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 MAP2K3P46734 347 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 INSL4Q14641 139 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 MALT1Q9UDY8 824 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ASB4Q9Y574 426 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 NUMA1Q14980 2115 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 P2RY2P41231 377 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CDH11P55287 796 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CDK3Q00526 305 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 GNA13Q14344 377 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TATDN3Q17R31 274 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TMEM107Q6UX40 140 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ADCK2Q7Z695 626 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 A0A1W2PR48 441 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 SURF4O15260 269 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 PCCBP05166 539 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 GAAP10253 952 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ACRP10323 421 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ALAS2P22557 587 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TRIM23P36406 574 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 CLCNKAP51800 687 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 FZD5Q13467 585 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 VRK2Q86Y07 508 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TMED9Q9BVK6 235 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms