RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC5A8Q8N695 610 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SFXN2Q96NB2 322 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF576Q9H609 170 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1W2PPK0 400 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FANCGO15287 622 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFB2O95178 105 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SCGB1D2O95969 90 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HRGP04196 525 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RETP07949 1114 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CD63P08962 238 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ANXA3P12429 323 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 AOAHP28039 575 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ETV4P43268 484 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TUBB3Q13509 450 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ELP5Q8TE02 316 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MYLIPQ8WY64 445 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR10A4Q9H209 315 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GPR39O43194 453 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ADH7P40394 386 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRLHRP49683 370 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 YPEL5P62699 121 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TLE3Q04726 772 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GAREM2Q75VX8 874 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KLBQ86Z14 1044 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ASB11Q8WXH4 323 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DDIT4LQ96D03 193 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MYH7P12883 1935 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SGK494L7N484 410 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLITRK5O94991 958 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 F11P03951 625 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CD3GP09693 182 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 THBS2P35442 1172 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FOXA1P55317 472 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TDGQ13569 410 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RADILQ96JH8 1075 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SMIM14Q96QK8 99 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 INPP5KQ9BT40 448 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CWH43Q9H720 699 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MROH6A6NGR9 719 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC6A8P48029 635 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRKXP51817 358 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 S100A10P60903 97 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SELENOWP63302 87 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SRYQ05066 204 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FGL2Q14314 439 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PIGGQ5H8A4 983 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 UEVLDQ8IX04 471 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TIGD4Q8IY51 512 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DEFB123Q8N688 67 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MYRFLQ96LU7 910 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC22A12Q96S37 553 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms