RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.03□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 FRG2CA6NGY1 282 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf84I3L1E1 186 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 KLF11O14901 512 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ACOX3O15254 700 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SNX4O95219 450 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PRF1P14222 555 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 DDCP20711 480 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PRPH2P23942 346 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ACVR2AP27037 513 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PTGER4P35408 488 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SOX18P35713 384 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SLC1A6P48664 564 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MASP1P48740 699 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 EMDP50402 254 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF7P61962 342 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R2AP63151 447 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SMU1Q2TAY7 513 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 KANK2Q63ZY3 851 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM198Q66K66 360 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ACAD11Q709F0 780 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 DDIASQ8IXT1 998 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 LIX1Q8N485 282 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.02□□□□□ -1.29
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SGMS1-201ENST00000361543 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ASB5Q8WWX0 329 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 RND1Q92730 232 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 KAT2AQ92830 837 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ARL8AQ96BM9 186 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SARAFQ96BY9 339 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ERP27Q96DN0 273 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 OMA1Q96E52 524 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD9Q96Q07 612 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 BBS4Q96RK4 519 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MECRQ9BV79 373 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 RUBCNLQ9H714 662 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MYNNQ9NPC7 610 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf109Q9NX04 203 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PRODH2Q9UF12 536 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 VPS13CQ709C8 3753 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 WDR91A4D1P6 747 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 WDR1O75083 606 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SEC22BO75396 215 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SLITRK5O94991 958 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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SGMS1-201ENST00000361543 DRD5P21918 477 aa7.01□□□□□ -1.29
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SGMS1-201ENST00000361543 NTSP30990 170 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MPIP34949 423 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 CASP3P42574 277 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PPICP45877 212 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ASMTP46597 345 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TRPC1P48995 793 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 CORO7P57737 925 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 NUP107P57740 925 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf80Q0P641 193 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PMPCAQ10713 525 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MPP2Q14168 576 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 CEBPEQ15744 281 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 GXYLT1Q4G148 440 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 WLSQ5T9L3 541 aa7.01□□□□□ -1.29
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