RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ICKQ9UPZ9 632 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RIPK3Q9Y572 518 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ENPP4Q9Y6X5 453 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR6C74A6NCV1 312 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R2P9O14990 202 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NCR1O76036 304 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SCG5P05408 212 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CYBAP13498 195 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 WEE1P30291 646 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ASCL1P50553 236 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SP2Q02086 613 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PLGLB1Q02325 96 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ST3GAL4Q11206 333 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FGL2Q14314 439 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MPEG1Q2M385 716 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 NAXDQ8IW45 347 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 STT3AP46977 705 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 CHIT1Q13231 466 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 PYCR2Q96C36 320 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ISM1B1AKI9 464 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 F6UZH7 168 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 H3BMQ9 156 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 TSPAN6O43657 245 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD11O43934 449 aa4.68□□□□□ -1.66
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