RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 CT45A9P0DMV2 189 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ETV4P43268 484 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SERPINB4P48594 390 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TRPC1P48995 793 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CORO7P57737 925 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TOMM20Q15388 145 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SLC35A4Q96G79 324 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 EGLN2Q96KS0 407 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NODALQ96S42 347 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 GNB5O14775 395 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TM9SF1O15321 606 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 AKAP10O43572 662 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 IFI6P09912 130 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 COX6B1P14854 86 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GABRA1P14867 456 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GPC1P35052 558 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GCKP35557 465 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 HPCAL1P37235 193 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GNRHR2Q96P88 292 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ADOQ96SZ5 270 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SNPHO15079 494 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 BIRC5O15392 142 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TBX19O60806 448 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ICOSLGO75144 302 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 HSPA4LO95757 839 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 HPNP05981 417 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CHRNB4P30926 498 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PTGER4P35408 488 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PNLIPRP2P54317 469 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PMPCAQ10713 525 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 HSPB3Q12988 150 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 XKR7Q5GH72 579 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 OR2L13Q8N349 312 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MTERF3Q96E29 417 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ELP4Q96EB1 424 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ZIM3Q96PE6 472 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 UBQLN3Q9H347 655 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 Q9N2J8 555 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GTF3C1Q12789 2109 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 WDR91A4D1P6 747 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 TTC36A6NLP5 189 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 UPK1AO00322 258 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PEX11AO75192 247 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ZWINTO95229 277 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 SERPINE1P05121 402 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 BCKDHAP12694 445 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 PTPN6P29350 595 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 NUP107P57740 925 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 DECR1Q16698 335 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 DESI1Q6ICB0 168 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-201ENST00000344376 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms