RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ZFP69Q49AA0 526 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM163Q8TC26 289 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRR-202ENST00000342084 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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PTPRR-202ENST00000342084 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRR-202ENST00000342084 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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PTPRR-202ENST00000342084 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 CD8B2A6NJW9 211 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 CASKO14936 926 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PLA2G10O15496 165 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 FCMRO60667 390 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 IL1AP01583 271 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRR-202ENST00000342084 THY1P04216 161 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 CD8BP10966 210 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ACP2P11117 423 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 MYOGP15173 224 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 DRD3P35462 400 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM23P36406 574 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SMSP52788 366 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM11AP58511 58 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 CD83Q01151 205 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 FGL2Q14314 439 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 KRT33BQ14525 404 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRR-202ENST00000342084 P2RY14Q15391 338 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 BBS10Q8TAM1 723 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SUSD6Q92537 303 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 KCTD7Q96MP8 289 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 WDFY2Q96P53 400 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SNX7Q9UNH6 387 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ASB4Q9Y574 426 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SZT2Q5T011 3432 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 B4DXG7 233 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SOCS6O14544 535 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PRODHO43272 600 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 NR2F6P10588 404 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 KIR2DL3P43628 341 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 MTNR1AP48039 350 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PDX1P52945 283 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SCN1BQ07699 218 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 RPA4Q13156 261 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SLC9A5Q14940 896 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PLK5Q496M5 336 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-202ENST00000342084 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.82□□□□□ -1.32
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