RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 CSRP2Q16527 193 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 ALG10BQ5I7T1 473 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 CYHR1Q6ZMK1 362 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 EGLN2Q96KS0 407 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 VDAC3Q9Y277 283 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 BCKDKO14874 412 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 SERPINA3P01011 423 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 SFTPDP35247 375 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 SLC6A12P48065 614 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 VWA2Q5GFL6 755 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 DCST2Q5T1A1 773 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 CES4AQ5XG92 561 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 OR1J4Q8NGS1 313 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 TESCQ96BS2 214 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 SGTBQ96EQ0 304 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF160Q9HCG1 818 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 CKLFQ9UBR5 152 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.15□□□□□ -0.78
SEC24C-201ENST00000339365 CLRN1P58418 232 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CBFBQ13951 182 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 MEP1AQ16819 746 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 C18orf63Q68DL7 685 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SLC48A1Q6P1K1 146 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 MISPQ8IVT2 679 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF671Q8TAW3 534 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 GPR179Q6PRD1 2367 aa10.15□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 C11orf98E9PRG8 122 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 DDAH2O95865 285 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CLPTM1O96005 669 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 APOA1P02647 267 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 MAOAP21397 527 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 FPR1P21462 350 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 HTR3AP46098 478 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 PON3Q15166 354 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM207Q6UWW9 146 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 OR4N4Q8N0Y3 316 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CDCP1Q9H5V8 836 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 RASSF1Q9NS23 344 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 ACACAQ13085 2346 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 H3BML4 177 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CBLP22681 906 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SMSP52788 366 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 LIM2P55344 173 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 AGERQ15109 404 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SLC34A3Q8N130 599 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 GPER1Q99527 375 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 UCK2Q9BZX2 261 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 C1orf21Q9H246 121 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 GALNT8Q9NY28 637 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 LRCH1Q9Y2L9 728 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 PAPLNO95428 1278 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 CD2P06729 351 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 ZGLP1P0C6A0 271 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 PEPDP12955 493 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF43P17038 809 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 HTR1EP28566 365 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SLC6A9P48067 706 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 UCNP55089 124 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 RGNQ15493 299 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 INAQ16352 499 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF528Q3MIS6 628 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SIRT6Q8N6T7 355 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 OLIG1Q8TAK6 271 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 MGAT4BQ9UQ53 548 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SH3PXD2BA1X283 911 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 SULT2B1O00204 365 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 HCRTR1O43613 425 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 PNMTP11086 282 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 TGFBR3Q03167 851 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 PRAMEF20Q5VT98 475 aa10.14□□□□□ -0.79
SEC24C-201ENST00000339365 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms