RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 SMARCD2Q92925 531 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 RIT1Q92963 219 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 TESCQ96BS2 214 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 RNF2Q99496 336 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 MYL10Q9BUA6 226 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 RAB18Q9NP72 206 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 PADI3Q9ULW8 664 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 COPS3Q9UNS2 423 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 A0A1W2PP64 1363 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3-202ENST00000327307 BTAF1O14981 1849 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 A0A1W2PQ27 194 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 A0A1W2PQ64 194 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 A0A1W2PQC6 194 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 H0YIG0 161 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 M0QXV9 152 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ACOT7O00154 380 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 OR2F2O95006 317 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MPIG6BO95866 241 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SERPINA1P01009 418 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ITGB2P05107 769 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 S100A8P05109 93 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CEACAM5P06731 702 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 FCGR1AP12314 374 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 GOT1P17174 413 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 KDELR2P33947 212 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ART1P52961 327 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ADPRHP54922 357 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 F2RL1P55085 397 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 E2F1Q01094 437 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 RELBQ01201 579 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 IFITM2Q01629 132 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DHODHQ02127 395 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ASAH1Q13510 395 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 VWC2Q2TAL6 325 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DOK6Q6PKX4 331 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 LYG2Q86SG7 212 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 STOML3Q8TAV4 291 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZNF480Q8WV37 535 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 NXNL1Q96CM4 212 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 COQ2Q96H96 371 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MRI1Q9BV20 369 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DDA1Q9BW61 102 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TRIM9Q9C026 710 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 C1orf198Q9H425 327 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.52□□□□□ -1.37
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RRN3-202ENST00000327307 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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RRN3-202ENST00000327307 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 EMSYQ7Z589 1322 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 A0A1W2PPC1 479 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.52□□□□□ -1.37
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RRN3-202ENST00000327307 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 LEFTY2O00292 366 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 RAMP3O60896 148 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SDC3O75056 442 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 IFNA21P01568 189 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 IFNGP01579 166 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TCRBP04435 133 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ERBB2P04626 1255 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SERPINE2P07093 398 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ARSAP15289 507 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 B4GALT1P15291 398 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 KLRC2P26717 231 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ACVR1BP36896 505 aa6.52□□□□□ -1.37
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