RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326197.11

SCMH1-201, Transcript of Scm polycomb group protein homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCMH1, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1-201ENST00000326197 LRG1P02750 347 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 SYPP08247 313 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 LIMS3P0CW19 117 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 LIMS4P0CW20 117 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CTGFP29279 349 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 NTSP30990 170 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 PDE7AQ13946 482 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ARHGEF6Q15052 776 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 KLK6Q92876 244 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 SCLYQ96I15 445 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 GPA33Q99795 319 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 MED18Q9BUE0 208 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 PIGUQ9H490 435 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 A0A1W2PPK0 400 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 H7BY64 318 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 PGRMC2O15173 223 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 UBXN7O94888 489 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 SOD1P00441 154 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CD3GP09693 182 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 DNASE1P24855 282 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 OPRD1P41143 372 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 TMEM25Q86YD3 366 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.55□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 EFCAB14O75071 495 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 NTN1O95631 604 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 DRD5P21918 477 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 IFNL1Q8IU54 200 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 OR51J1Q9H342 316 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 RDH8Q9NYR8 311 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 RASD1Q9Y272 281 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CACNG2Q9Y698 323 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 A0A1W2PRQ8 180 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 PLPP1O14494 284 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 IFNA7P01567 189 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 GIFP27352 417 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 IRS1P35568 1242 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CPOQ8IVL8 374 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 LINC00471Q8N535 108 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CEP76Q8TAP6 659 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 DAPL1A0PJW8 107 aa9.53□□□□□ -0.88
SCMH1-201ENST00000326197 LEFTY2O00292 366 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms