RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA16P05015 189 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FESP07332 822 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 HBQ1P09105 142 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RHCEP18577 417 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TNNI3P19429 210 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FPR1P21462 350 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNSP34059 522 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGER1P34995 402 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DCTP40126 519 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ5P48544 419 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYBA2P53672 197 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD23AP54725 363 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM11AP58511 58 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MERTKQ12866 999 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ERV3-1Q14264 604 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PDK3Q15120 406 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP7Q16829 419 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI44Q8TCB0 444 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TFAP2CQ92754 450 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CTHRC1Q96CG8 243 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GIMAP5Q96F15 307 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35A4Q96G79 324 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 STACQ99469 402 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 THSD1Q9NS62 852 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 USE1Q9NZ43 259 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 AK5Q9Y6K8 562 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GX78 115 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC36A6NLP5 189 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YAE9 185 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BMH7 237 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF11BO00300 401 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK2AP1O14519 115 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MED26O95402 600 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 H6PDO95479 791 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 AK1P00568 194 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ALPLP05186 524 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.96e-18■■■■■ 26.9
RABGGTB-201ENST00000319942 STT3AP46977 705 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1D4P47884 311 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1E2P47887 323 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CHN2P52757 468 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MGAT2Q10469 447 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT16Q17RD7 645 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FHL5Q5TD97 284 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC23Q5W5X9 447 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT80Q6KB66 452 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CYGBQ8WWM9 190 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GATA6Q92908 595 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FKBP10Q96AY3 582 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CNBD2Q96M20 576 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EPYCQ99645 322 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PIP5K1AQ99755 562 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ADI1Q9BV57 179 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 BATF3Q9NR55 127 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SCOCQ9UIL1 159 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf18Q9UK00 162 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms