RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297598.4

PDP1-201, Transcript of pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDP1, Length 4,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1-201ENST00000297598 DEFB134Q4QY38 66 aa14.53□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.53□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 VRK2Q86Y07 508 aa14.53□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 GJD3Q8N144 294 aa14.53□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 OR8S1Q8NH09 359 aa14.53□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.53□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.53□□□□□ -0.08
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PDP1-201ENST00000297598 VITQ6UXI7 678 aa14.52□□□□□ -0.08
PDP1-201ENST00000297598 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.52□□□□□ -0.08
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PDP1-201ENST00000297598 UGDHO60701 494 aa14.52□□□□□ -0.08
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PDP1-201ENST00000297598 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
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PDP1-201ENST00000297598 PGDP52209 483 aa14.52□□□□□ -0.08
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PDP1-201ENST00000297598 H0YIV9 168 aa14.52□□□□□ -0.09
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PDP1-201ENST00000297598 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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PDP1-201ENST00000297598 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.52□□□□□ -0.09
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PDP1-201ENST00000297598 WDR26Q9H7D7 661 aa14.51□□□□□ -0.09
PDP1-201ENST00000297598 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.51□□□□□ -0.09
PDP1-201ENST00000297598 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
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PDP1-201ENST00000297598 CEP290O15078 2479 aa14.51□□□□□ -0.09
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