RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 TP53INP1Q96A56 240 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ST6GAL2Q96JF0 529 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ERI3O43414 337 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 IFNA8P32881 189 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ERVK-21P61565 698 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ST3GAL3Q11203 375 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 NUMA1Q14980 2115 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ZFP69Q49AA0 526 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ABHD17CQ6PCB6 329 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ZNF730Q6ZMV8 503 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 HMGN2P46Q86SG4 172 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ACOT4Q8N9L9 421 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 OR8D4Q8NGM9 314 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 RFKQ969G6 155 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 PRDM7Q9NQW5 492 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 LIPT1Q9Y234 373 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 MYO10Q9HD67 2058 aa26.29■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 CCDC182A6NF36 153 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 AP3D1O14617 1153 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
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UBP1-201ENST00000283628 ALPPP05187 535 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 AHRP35869 848 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 IL12RB1P42701 662 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 AGERQ15109 404 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 TAB1Q15750 504 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ZNF628Q5EBL2 1059 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R2DQ66LE6 453 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 CCDC116Q8IYX3 515 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 OR8K5Q8NH50 307 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 DIO2Q92813 273 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 COQ7Q99807 217 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 WDR26Q9H7D7 661 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ATG4BQ9Y4P1 393 aa26.28■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 LIMS3P0CW19 117 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 LIMS4P0CW20 117 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 GAAP10253 952 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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UBP1-201ENST00000283628 SLC48A1Q6P1K1 146 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 TMEM107Q6UX40 140 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 RDH10Q8IZV5 341 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 OR2L5Q8NG80 312 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 OR7D2Q96RA2 312 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 TEX12Q9BXU0 123 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 SLC38A1Q9H2H9 487 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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UBP1-201ENST00000283628 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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UBP1-201ENST00000283628 RRM2BQ7LG56 351 aa26.27■■□□□ 1.8
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF485Q8NCK3 441 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 PIGXQ8TBF5 258 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 C16orf58Q96GQ5 468 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 XKR8Q9H6D3 395 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 GIMAP4Q9NUV9 329 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 CES1P1Q9UKY3 287 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.27■■□□□ 1.8
UBP1-201ENST00000283628 MPIP34949 423 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 DRD3P35462 400 aa26.26■■□□□ 1.79
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UBP1-201ENST00000283628 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa26.26■■□□□ 1.79
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UBP1-201ENST00000283628 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D3BA6NDS4 549 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 CENPXA8MT69 81 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 C4orf51C9J302 202 aa26.26■■□□□ 1.79
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UBP1-201ENST00000283628 OMPP47874 163 aa26.26■■□□□ 1.79
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UBP1-201ENST00000283628 DUSP2Q05923 314 aa26.26■■□□□ 1.79
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UBP1-201ENST00000283628 OR52P1PQ8NH57 321 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SARGQ9BW04 601 aa26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
UBP1-201ENST00000283628 SEMA4GQ9NTN9 838 aa26.26■■□□□ 1.79
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