RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251102.12

CNGB1-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel beta 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGB1, Length 5,641 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1-201ENST00000251102 DEFB118Q96PH6 123 aa14.7□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PRAMEF2O60811 474 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CD3GP09693 182 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 NR2C1P13056 603 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TYRP14679 529 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 KDELC1Q6UW63 502 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR5B12Q96R08 314 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR2M2Q96R28 347 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TREX1Q9NSU2 369 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TSPAN15O95858 294 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 IFNA5P01569 189 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CYP17A1P05093 508 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 BPIP17213 487 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 HACD4Q5VWC8 232 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 A0A0A6YYH2 397 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 A6NIN4 97 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 A6NJ64 397 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LEFTY1O75610 366 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CD6P30203 668 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MGAT3Q09327 533 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TP53I3Q53FA7 332 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CBLL1Q75N03 491 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CEP68Q76N32 757 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LSMEM2Q8N112 164 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ACBD4Q8NC06 268 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ARSAP15289 507 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PRSS3P35030 304 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PBX2P40425 430 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TXNDC15Q96J42 360 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.69□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ADORA3P0DMS8 318 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SLC11A1P49279 550 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 DYRK1AQ13627 763 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ESX1Q8N693 406 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF709Q8N972 641 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SNX18Q96RF0 628 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OCEL1Q9H607 264 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 F2P00734 622 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CSF1P09603 554 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MANEALQ5VSG8 457 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LAX1Q8IWV1 398 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MZB1Q8WU39 189 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LMF1Q96S06 567 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF559Q9BR84 538 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CLMPQ9H6B4 373 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TNFRSF10BO14763 440 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MAOAP21397 527 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CADM3Q8N126 398 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 RASD1Q9Y272 281 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 POM121CA8CG34 1229 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PPP1R3DO95685 299 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PFKMP08237 780 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF35P13682 527 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms