RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 3110001I22RikQ9CZ70 312 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pbld1Q9DCG6 288 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sppl2aQ9JJF9 523 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sars2Q9JJL8 518 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap77A0A087WRI3 283 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr396-ps1A0A0U1RNF5 211 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hs3st4D3YVV6 449 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtpbp1O08582 668 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl7a1O54830 266 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CaskO70589 926 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nfatc1O88942 717 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1bP36993 390 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pebp1P70296 187 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp280bQ505F4 534 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MeikinQ5F2C3 434 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glt8d2Q640P4 349 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GnptgQ6S5C2 307 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smyd4Q8BTK5 799 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nmral1Q8K2T1 309 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r83Q8R287 306 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TapbplQ8VD31 451 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1302Q8VGE9 315 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacng6Q8VHW3 260 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam3cQ91VU0 227 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpx6Q91WR8 221 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem159Q922Z1 161 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Camk2gQ923T9 529 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MrgprhQ99MT8 321 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SdhcQ9CZB0 169 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Actl11Q9D5V1 1207 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slamf9Q9D780 285 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Erp27Q9D8U3 272 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpn2Q9DBB9 547 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Emc7Q9EP72 241 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem37Q9JJV3 211 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pard6gQ9JK84 382 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dclk1Q9JLM8 756 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnj10Q9JM63 379 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ItgaxQ9QXH4 1169 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serinc3Q9QZI9 472 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8251F6VUT6 1994 aa6.25□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp534A2A7A1 661 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem215A7E1Z1 235 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gml2G5E8L7 176 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr694K7N641 315 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr209L7N1X3 305 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a1O08966 556 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NnmtO55239 264 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5571P01639 130 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pou2f3P31362 431 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FpgsP48760 587 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fmo1P50285 532 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkx3-2P97503 333 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcfl5Q32NY8 489 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dennd1bQ3U1T9 766 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CamkmtQ3U2J5 323 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TepsinQ3U3N6 573 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ube2fbQ3UWQ3 185 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm906Q3V0M1 1017 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EgflamQ4VBE4 1017 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nt5eQ61503 576 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema3bQ62177 748 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SypQ62277 314 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxl19Q6PB97 674 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scgb2b2Q6UGQ3 114 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AY358078Q6UY53 465 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnk12Q76M80 430 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1140Q7TR39 311 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgr15lQ80T54 456 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ap4e1Q80V94 1122 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BspryQ80YW5 473 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Poldip3Q8BG81 420 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gen1Q8BMI4 908 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam92aQ8BP22 355 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn7Q8BUM3 359 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxw14Q8C2Y5 466 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rae1Q8C570 368 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mfsd6Q8CBH5 775 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Unc5dQ8K1S2 956 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem268Q8R239 342 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gipc3Q8R5M0 297 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr599Q8VG01 315 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd54Q91WK7 299 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clp1Q99LI9 425 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trappc5Q9CQA1 188 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp5dQ9D3D9 168 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r52Q9EP79 309 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa6.24□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PalmdQ9JHU2 551 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.7 ms