RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pon2Q62086 354 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Enkd1Q7TSV9 346 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc126Q8BIS8 140 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsoQ8BM88 312 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb49Q8BXX2 756 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr153Q8K0Z9 631 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r69Q8VIC1 319 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spred1Q924S8 444 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acss2Q9QXG4 701 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhb1Q9QYE9 243 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubqln2Q9QZM0 638 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ramp2Q9WUP0 189 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17190V9GX38 357 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex28B1AYN9 409 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst13D3Z6E3 336 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 8030474K03RikE9Q4Y8 554 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6619F6URP1 175 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr171G5E8J1 314 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp934K7N6H3 473 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmc3ipO35047 217 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zw10O54692 779 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtx2O88441 263 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ica1P97411 478 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox14Q04892 240 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B4galnt2Q09199 510 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ptchd1Q14B62 888 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1307Q7TQX1 312 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PeloQ80X73 385 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NanogQ80Z64 305 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk10Q8BUW1 535 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slitrk6Q8C110 840 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Micu2Q8CD10 432 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a46Q9CQS4 418 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem179bQ9CY24 219 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr71Q9QZ18 312 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC034090A0A087WP46 1202 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17174M0QWQ9 212 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C9P06683 548 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Barhl1P63157 327 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr2cP97760 275 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcbtb1Q6NXM2 531 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prmt8Q6PAK3 394 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdh19Q80TF3 1145 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrtm2Q8BGA3 515 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B4gat1Q8BWP8 415 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sall4Q8BX22 1067 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf322Q8BZ89 410 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FntbQ8K2I1 437 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FggQ8VCM7 436 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr77Q8VEY9 312 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9230112D13RikQ9D260 137 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec23bQ9D662 767 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lypd2Q9DD23 127 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr4Q9QUK6 835 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox2dW4VSN9 191 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep295Q8BQ48 2412 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8127E9Q0P0 100 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2d37-psF6YKB5 150 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8094K7N6U8 211 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TepsinQ3U3N6 573 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex10Q3URQ0 928 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chpt1Q8C025 398 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps9d1Q8C190 649 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prokr2Q8K458 381 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2afjQ8R1M2 129 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr811Q8VFI1 319 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr986Q8VFN6 312 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Khdc3Q9CWU5 440 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BlvraQ9CY64 295 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp84Q9D654 559 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9DAR0 182 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pkmyt1Q9ESG9 490 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TesminQ9WTJ6 475 aa11.94□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5938A2AEN9 163 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgbd5D3YZI9 523 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AU018091E9PWS4 684 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NsmafO35242 920 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Man2b2O54782 1018 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtnd5P03921 607 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox6P40645 827 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrpap1P55302 360 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Malt1Q2TBA3 832 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rars2Q3U186 578 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oog2Q7TPX8 476 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ldoc1Q7TPY9 151 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bpifb2Q8C1E1 462 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il17rdQ8JZL1 738 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms