RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 CBLCQ9ULV8 474 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 DOCK7Q96N67 2140 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 TO15178 435 aa20.11■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 ULK1O75385 1050 aa20.11■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.11■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 KEAP1Q14145 624 aa20.09■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 NODALQ96S42 347 aa20.09■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 TACR1P25103 407 aa20.08■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 GSTM5P46439 218 aa20.08■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.08■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 SLC29A2Q14542 456 aa20.08■□□□□ 0.81
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