RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ENPP6Q6UWR7 440 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 WFDC11Q8NEX6 87 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 OR52R1Q8NGF1 315 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 WNT2BQ93097 391 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF681Q96N22 645 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 DACH2Q96NX9 599 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PRODH2Q9UF12 536 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 H0Y3Z8 333 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 TO15178 435 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PDYNP01213 254 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 HRGP04196 525 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 HOXC12P31275 282 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CASQ1P31415 396 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GFRA1P56159 465 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SLC7A5Q01650 507 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL29Q96CT2 875 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 G6PC3Q9BUM1 346 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 BRF2Q9HAW0 419 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT8Q9NY28 637 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PPP6CO00743 305 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 PCSK2P16519 638 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SRYQ05066 204 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 LTB4RQ15722 352 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 LUZP2Q86TE4 346 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 RDH11Q8TC12 318 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R10Q9NYW0 307 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CLCF1Q9UBD9 225 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 DNHD1Q96M86 4753 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 FRG2CA6NGY1 282 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 OR6C70A6NIJ9 312 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 OTCP00480 354 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 HMGCS1Q01581 520 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 PLXDC2Q6UX71 529 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 IFNEQ86WN2 208 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 PLCZ1Q86YW0 608 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TMBIM1Q969X1 311 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TMCO6Q96DC7 493 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 COL21A1Q96P44 957 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 FUT8Q9BYC5 575 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SNX6Q9UNH7 406 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PPR1 153 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SH3D21A4FU49 640 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 COL6A2P12110 1019 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CD53P19397 219 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CPA2P48052 419 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH9A1P49189 494 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 LHX2P50458 406 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CDH13P55290 713 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 POU4F3Q15319 338 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 BIVMQ86UB2 503 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 MED12LQ86YW9 2145 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 RELL1Q8IUW5 271 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SMPDL3BQ92485 455 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 PIGMQ9H3S5 423 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 REM1O75628 298 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 INHBAP08476 426 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 DRD2P14416 443 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN8P19075 237 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CHMP24386 653 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SRD5A2P31213 254 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 STARP49675 285 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 GAB1Q13480 694 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 AAGABQ6PD74 315 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 GCNT2Q8N0V5 402 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF675Q8TD23 568 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35A4Q96G79 324 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD9Q96Q07 612 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 HEY2Q9UBP5 337 aa22.61■■□□□ 1.21
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