RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602212.5

NPAS1-208, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS1, Length 2,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPAS1-208	ENST00000602212	INAVA	Q3KP66	663 aa		21.33	■■□□□ 1.01
NPAS1-208	ENST00000602212	MLIP	Q5VWP3	458 aa		21.33	■■□□□ 1.01
NPAS1-208	ENST00000602212		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
NPAS1-208	ENST00000602212	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		21.33	■■□□□ 1.01
NPAS1-208	ENST00000602212	PITX2	Q99697	317 aa		21.33	■■□□□ 1.01
NPAS1-208	ENST00000602212	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		21.33	■■□□□ 1.01
NPAS1-208	ENST00000602212	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		21.33	■■□□□ 1.01
NPAS1-208	ENST00000602212	FITM1	A5D6W6	292 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	IFI6	P09912	130 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SLC35E2	P0CK97	266 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	AGXT	P21549	392 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CSF2RB	P32927	897 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	GPR3	P46089	330 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	HPCA	P84074	193 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SYT16	Q17RD7	645 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	MUC3A	Q02505	3323 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CACNA1E	Q15878	2313 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CBL	P22681	906 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SEPHS1	P49903	392 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	VRK2	Q86Y07	508 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	APOL4	Q9BPW4	351 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	PIGU	Q9H490	435 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		21.32	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	HR	O43593	1189 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	AHCYL1	O43865	530 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	PEX19	P40855	299 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SLC13A2	Q13183	592 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CDK5R2	Q13319	367 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	NR1D2	Q14995	579 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	FGD3	Q5JSP0	725 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CARF	Q8N187	725 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	OR10H2	O60403	315 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	MAPK10	P53779	464 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	GPLD1	P80108	840 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	GAB3	Q8WWW8	586 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	MKLN1	Q9UL63	735 aa		21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SYT5	O00445	386 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	LAMTOR5	O43504	91 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	PCDHGA12	O60330	932 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CD1C	P29017	333 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	AVPR1B	P47901	424 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	HSD11B2	P80365	405 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ERV3-1	Q14264	604 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	GRM7	Q14831	915 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SEC23B	Q15437	767 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	NPTX1	Q15818	432 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF773	Q6PK81	442 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	WDR45	Q9Y484	360 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212		H3BMH7	237 aa		21.29	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	SLC1A7	O00341	560 aa		21.29	■■□□□ 1
NPAS1-208	ENST00000602212	CTNS	O60931	367 aa		21.29	■■□□□ 1

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