RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 AIFM1O95831 613 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PTHP01270 115 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ACADMP11310 421 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOGP15173 224 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL12AP19105 171 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NTSR1P30989 418 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 IGFALSP35858 605 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 WASP42768 502 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SMSP52788 366 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFA1P59665 94 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFA3P59666 94 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MED22Q15528 200 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 GPAT3Q53EU6 434 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 LCN9Q8WX39 176 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 GABRG3Q99928 467 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KXD1Q9BQD3 176 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 APOOQ9BUR5 198 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCG4Q9H172 646 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 XKR8Q9H6D3 395 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 FZD3Q9NPG1 666 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SELENONQ9NZV5 590 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 C5AR2Q9P296 337 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RHCGQ9UBD6 479 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL3Q9UH77 587 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT52Q9Y366 437 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SPACA6W5XKT8 324 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ISM1B1AKI9 464 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 FFAR1O14842 300 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ENTPD6O75354 484 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 UPK1BO75841 260 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB36O95755 333 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PTTG1O95997 202 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SCG5P05408 212 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ASGR2P07307 311 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 HSMCR30P0CW71 290 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 F3P13726 295 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKAR1BP31321 381 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC15A1P46059 708 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PCYT1AP49585 367 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ADPRHP54922 357 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R41P59536 307 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NFATC4Q14934 902 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KIR2DS3Q14952 304 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAM2Q15035 370 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NCF4Q15080 339 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SYPL1Q16563 259 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL22Q53GT1 634 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 EIPR1Q53HC9 387 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC36A4Q6YBV0 504 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 USP30Q70CQ3 517 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRED2Q7Z698 418 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ASPGQ86U10 573 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8K5Q8NH50 307 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5CQ8TCD5 201 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms