RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CTHRC1Q96CG8 243 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSGQ96EG1 525 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF21BQ96EK2 531 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 NTMT1Q9BV86 223 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB26Q9HCK0 441 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 AHSPQ9NZD4 102 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf226A1L170 272 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF13O75888 250 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 LHX2P50458 406 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 LTB4RQ15722 352 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 SGO1Q5FBB7 561 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM219BQ5XKK7 198 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM180BQ6P0A1 224 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGMQ9H3S5 423 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R10Q9NYW0 307 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL2Q9UKC9 423 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 PCTPQ9UKL6 214 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 TESMINQ9Y4I5 508 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-211ENST00000590874 MED12Q93074 2177 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MXE2 369 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PLOD2O00469 737 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CPOXP36551 454 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGCS1Q01581 520 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CAV1Q03135 178 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT88Q13099 833 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC4APQ8TEL6 797 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL29Q96CT2 875 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS11Q9H270 941 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ACBD3Q9H3P7 528 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PACSIN3Q9UKS6 424 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A4Q9UP95 1085 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GTL3 188 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CASKO14936 926 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 HEXAP06865 529 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PCSK2P16519 638 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 DRD5P21918 477 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TYK2P29597 1187 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PPICP45877 212 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 EMDP50402 254 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB8P50452 374 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN18P56856 261 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCZ1Q86YW0 608 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4F6Q8NGB9 312 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TMBIM1Q969X1 311 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TM4SF18Q96CE8 201 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PNV4 684 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 FRG2CA6NGY1 282 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TO15178 435 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SIAH2O43255 324 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCY1B2O75343 617 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TGM6O95932 706 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF708P17019 499 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SRD5A2P31213 254 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 DIO3P55073 304 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GAB1Q13480 694 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GGTA1PQ4G0N0 100 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 Q5PR19 223 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF592Q92610 1267 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF681Q96N22 645 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 COL21A1Q96P44 957 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOVL6Q9H5J4 265 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRA2Q9H9E1 313 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PRODH2Q9UF12 536 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 NDRG3Q9UGV2 375 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 WIF1Q9Y5W5 379 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C70A6NIJ9 312 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 B4DXG7 233 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 STX16O14662 325 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 HCRTR2O43614 444 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP24386 653 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM27E3Q08E93 113 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 AAGABQ6PD74 315 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCO6Q96DC7 493 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SFXN2Q96NB2 322 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB17Q9H0T7 212 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 XPR1Q9UBH6 696 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 NME6O75414 186 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6G6DO95868 133 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PDYNP01213 254 aa23.22■■□□□ 1.31
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