RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 NUDT17P0C025 328 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SBK3P0C264 359 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PCSK2P16519 638 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 KRT15P19012 456 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TSPAN8P19075 237 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DNASE1P24855 282 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CTSSP25774 331 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DGKQP52824 942 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PPP2R2AP63151 447 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ADAM8P78325 824 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OR52R1Q8NGF1 315 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OR1J4Q8NGS1 313 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TUBA1CQ9BQE3 449 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OSBPL11Q9BXB4 747 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ANKRA2Q9H9E1 313 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZNF225Q9UK10 706 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 C17orf51A8MQB3 221 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ICOSLGO75144 302 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PDYNP01213 254 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SHBGP04278 402 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EPXP11678 715 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EMDP50402 254 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CDH13P55290 713 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 MAP4K2Q12851 820 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 IFT88Q13099 833 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 POU4F3Q15319 338 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RDH11Q8TC12 318 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 KLHL29Q96CT2 875 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 MBD6Q96DN6 1003 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 LRRC46Q96FV0 321 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZNF681Q96N22 645 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CALHM2Q9HA72 323 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 FETUBQ9UGM5 382 aa11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 C1orf226A1L170 272 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CLCA1A8K7I4 914 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 A8MT66 165 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 IL18BPO95998 194 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ACTL6AO96019 429 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RAF1P04049 648 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RBP1P09455 135 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CYP4B1P13584 511 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CHN1P15882 459 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 NAGAP17050 411 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GCAP28676 217 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OPRM1P35372 400 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ALDH9A1P49189 494 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SORDQ00796 357 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SRYQ05066 204 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RCAN2Q14206 197 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CASP8Q14790 479 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SLC30A6Q6NXT4 461 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 MILR1Q7Z6M3 343 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 KIF18BQ86Y91 864 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GCNT2Q8N0V5 402 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TMBIM1Q969X1 311 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PAFAH2Q99487 392 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GALNT8Q9NY28 637 aa11□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 AHSPQ9NZD4 102 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms