RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586963.1

CAPNS1-203, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAPNS1, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-203ENST00000586963 A0A1W2PPR1 153 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 H0Y3Z8 333 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 STX16O14662 325 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ARHGEF9O43307 516 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ABCB7O75027 752 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 UGT2B11O75310 529 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 CBX7O95931 251 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 CRHP06850 196 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 RBP1P09455 135 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 INHBBP09529 407 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 FREM3P0C091 2139 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 SRD5A2P31213 254 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 CPA2P48052 419 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 EMDP50402 254 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 SERPINB8P50452 374 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 MAPK12P53778 367 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 DIO3P55073 304 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PSPHP78330 225 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 HMGCS1Q01581 520 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TRAF3Q13114 568 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 BCL2A1Q16548 175 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 DESI1Q6ICB0 168 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 AAGABQ6PD74 315 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 LUZP2Q86TE4 346 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 IFNEQ86WN2 208 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TMCO6Q96DC7 493 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PHF21BQ96EK2 531 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PIP5K1AQ99755 562 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ITPAQ9BY32 194 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-203ENST00000586963 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 SERHLQ9NQF3 203 aa7.29□□□□□ -1.24
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CAPNS1-203ENST00000586963 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PCTPQ9UKL6 214 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 C2orf72A6NCS6 295 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 FRG2CA6NGY1 282 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PLOD2O00469 737 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 MSTNO14793 375 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 HCRTR2O43614 444 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 SMIM24O75264 130 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TNFSF13O75888 250 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 CNTFP26441 200 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 LHX2P50458 406 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 SRYQ05066 204 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 POU4F3Q15319 338 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 NNATQ16517 81 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF675Q8TD23 568 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 RNF138Q8WVD3 245 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ERP27Q96DN0 273 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-203ENST00000586963 ARSGQ96EG1 525 aa7.28□□□□□ -1.24
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